Activités du Centre de Ressources Biologiques

La Biobanque de Gustave Roussy prend en charge les matrices biologiques suivantes :

• Sang
• Urines
• Salive
• Selles
• Cheveux
• Tissus congelés (biopsies, pièces opératoires)
• Tissus fixés (FFPE)
• Acides nucléiques (ADN, ARN)

Elle assure la réalisation des activités suivantes :

Membres de l’équipe du BMO

• Lacroix Ludovic, Biologiste/Responsable
• Jacques Nathalie,Cadre laboratoire RT
• Saulnier Patrick, Ingénieur biologiste
• Camara-Clayette Valérie, Ingénieur biologiste
• Jovelet Cécile, Post Doctorante
• Honoré Aurélie,Technicienne
• Laporte Mélanie,Technicienne
• Lecourt Hélène,Technicienne
• Louis Maxime,Technicien
• Motté Nelly, Technicienne
• Paume Clélia,Technicienne
• Richon Catherine,Technicienne

Equipement du BMO

• 2 Bioanalyseurs 2100 (Agilent)
• 1 Nanodrop pour quantification d’échantillons (Ozyme)
• 1 Liquidator (Mettler Toledo)
• 2 QBIT quantification d’échantillons (Labtech )
• 6 blocs PCR (96puits)
• 1 bloc Vii7 PCR Quanti 96puits (LifeTechnologie)
• 2 blocs PCR VERITI (LifeTechnologie)
• 1 Extracteur ADN EZ1 (Qiagen)
• 1 Séquenceur 48 Capillaires mutualisé avec Biopath (LifeTechnologie)
• 2 PGM IonTorrent + 3 OneTouch, séquençage NGS (Life Technologie)
• 1 Plateforme Affimetrix

Module de Biopathologie Moléculaire (BMO)

Ce module est rattaché à la plateforme de génomique de Gustave Roussy.

Le module BioPathologie Moléculaire (BMO) réalise des analyses moléculaires (séquençage de plus de 350 cibles, PCR, QPCR, NGS…) dans le cadre d’essais cliniques ou de projets de recherche. Ce module est également impliqué dans les analyses mutationnelles relatives au programme de Médecine Personnalisée de Gustave Roussy.

Membres de l’équipe de la plateforme de métabolomique​

• Guido Kroemer, Responsable scientifique
• Sylvère Durand, Responsable opérationnel
• Mélanie Bourgin, Biochimiste Post-doctorante
• Fanny Aprahamian, Assistante technique
• Nitharsshini Nirmalathasan, Apprentie

Plateforme de métabolomique

La plateforme est équipée de quatre systèmes chromatographie/spectromètre de masse complémentaires, ainsi que

Plateforme de métabolomique

Les spectromètres de masse équipant la plateforme métabolomique permettent la mesure de toutes les classes potentielles de métabolites, aussi bien pour des approches ciblées que non ciblées.

Le profilage (non-ciblé) est réalisé au moyen d’un spectromètre de masse haute résolution (high resolution mass spectrometer, HRMS) couplé à une chromatographie ultra haute performance (ultra-high performance liquid chromatography, UHPLC).

Members de l'équipe

• Responsable : Nathalie DROIN, PhD
  (nathalie.droin@gustaveroussy.fr)
• Marie BRECKLER, Technicienne de laboratoire
• Betty LEITE, Technicienne de laboratoire
• Audrey NAIMO, Technicienne de laboratoire
• Maëla FRANCILLETTE, Ingénieure
• Béatrice FIET, Assistante de gestion

Adresse email collective : GD-UGF@gustaveroussy.fr

Equipement

• 2 Bioanalyzer 2100 (Agilent)
• 1 FragmentAnalyzer (Agilent)
• 1 S220 Ultrasonicator (Covaris)
• 1 E220 Ultrasonicator (Covaris)

• 1 Robot Bravo (Agilent)
• 1 Robot SpriWorks (Beckman)

• 2 Chromium™ Controller (10X Genomics)
• 1 Tapestri (Mission Bio)

• 1 NovaSeq6000 (Illumina)
• 1 MiSeq (Illumina)
• 1 MiniSeq (Illumina)
• 1 PromethION 48 (Oxford Nanopore)

Plateforme de génomique fondamentale

La plateforme de Génomique de l’US AMMICa (INSERM US23 / CNRS UMS3655) de Gustave Roussy a pour mission de caractériser les cancers et les modèles expérimentaux grâce à des approches de génomique innovantes.

En 2011, la plateforme de génomique a mis en place un module de séquençage à haut débit basé sur la technologie d’Illumina (HiSeq 2000 remplacé par un NovaSeq 6000 en 2017, MiSeq et MiniSeq) et tous les équipements nécessaires qui entourent ces séquenceurs (robots pour les préparations pré-analytiques et des serveurs).