Gustave Roussy a fait de ses plateformes technologiques des services communs, dont la jouissance est partagée entre toutes les composantes de sa recherche. Cette mutualisation favorise les interactions et participe du continuum de la recherche.

Ces plateformes sont regroupées au sein de l'UMS AMMICa (CNRS UMS 3655 / Inserm US 23) :

Equipe

• Responsables :
  Isabelle PLO-AZEVEDO (DR2 INSERM), Hana RASLOVA (DR2 INSERM)
• Chercheurs :
  Isabelle GODIN (DR2 CNRS), William VAINCHENKER (DRE INSERM), Najet DEBILI (DRE CNRS), Jean-Luc VILLEVAL (DRE INSERM), Monika WITTNER (CR1 CNRS), Antonio DI STEFANO (CRCN INSERM), Caroline MARTY (CRCN INSERM), Iléana ANTONY-DEBRE (CRCN INSERM)        
• Cliniciens/biologistes :
  Rémi FAVIER (PH APHP, Christine BELLANNE (MCU-PH / Interface INSERM), Florence PASQUIER (PH IGR), Christophe MARZAC (PH IGR), Jean-Baptiste MICOL (PH IGR)

Publications majeures

• Toppaldoddi KR, da Costa Cacemiro M, Bluteau O, Panneau-Schmaltz B, Pioch A, Muller D, Villeval JL, Raslova H, Constantinescu SN, Plo I, Vainchenker W, Marty C. Rare type 1-like and type 2-like calreticulin mutants induce similar myeloproliferative neoplasms as prevalent type 1 and 2 mutants in mice. Oncogene. 2019 Mar;38(10):1651-1660.

Des cellules souches hématopoïétiques aux mégacaryocytes

Cette équipe est rattachée à l’UMR 1287 - Cellules souches hématopoïétiques et développement des hémopathies myéloïdes

Notre recherche:

Membres de l’équipe de la plateforme de bioinformatique

• Responsable : Marc Deloger (marc.deloger@gustaveroussy.fr)
• Bioinformaticiens "Core Service" (statutaires) : Thibault Dayris, M’boyba Diop, Bastien Job, Gérôme Jules-Clement, Franck Le-Layo
• Bioinformaticiens "Core Service" (non-permanents) : Marine Aglave, Edi Tihic
• Bioinformaticiens "Core Service" (stagiaires) :

Activités de la plateforme de bioinformatique

• Analyse de données de séquençage en (épi)génomique/transcriptomique (WGS/WES/TGS, RNA-seq, ChIP/ATAC-seq, Single-Cell, Long Reads)
• Gestion des données (récupération, centralisation, organisation, étiquetage, mise à disposition/partage)
• Support aux bioinformaticiens, biologistes, et cliniciens de Gustave Roussy
• Aide à la publication (matériel et méthodes, figures, dépôt des données sur les bases de données publiques comme GEO/SRA/EGA/dbGAP)

Equipe

Responsable scientifique
Pr Nathalie Chaput-Gras
E-mail

Responsable opérationnel
Dr Lydie Cassard

Assistante Hospitalo-Universitaire
Dr Marie Naigeon

Ingénieur
Jean Jouniaux

Ingénieur d’étude
Lisa Boselli

Technicien
Jonathan Grivel
 

Equipements

• 1 MACSQuant 16 Cytometer – Miltenyi Biotec Inc.
• 1 CytoFLEX S base Cytometer – Beckman Coulter
• 2 GALLIOS Cytometer – Beckman Coulter
• MAGPIX Multiplexing System – Luminex B.V.
• MESO QuickPlex SQ 120 – Meso Scale Discovery (LRTI)
• GentleMACS Dissociator - Miltenyi Biotec Inc.
• Vi-CELL XR Cell Analyzer – Beckman Coulter
• xCELLigence RTCA - Agilent

Activités

Le laboratoire d’Immunomonitoring en oncologie (LIO), créé fin 2014, est une unité de recherche translationnelle. Le principal objectif du laboratoire est d’identifier des biomarqueurs sanguins ou tumoraux pouvant prédire la réponse ou la résistance aux immunothérapies anti-tumorales, ainsi que l’émergence de certains effets indésirables immunologiques pouvant être liés à ces traitements. Un autre objectif est de comprendre les mécanismes d’action des immunothérapies anti-tumorales.

Centre de Resources Biologiques - Contacts

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